研究所擁有多種從事植物分子生物學、生物技術和藥物化學研究相關的大中型現代儀器設備,包括植物分子生物學研究的高通量測序儀、遺傳分析系統、蛋白質雙向電泳系統、定量PCR儀、大型人工氣候箱群、高速和超高速離心機、低溫和超低溫貯藏系統、大型溫室體系、百萬和千萬分之一天平、400兆和500兆超導核磁共振儀、高分辨質譜儀、激光共聚焦顯微鏡等。標本館收藏植物標本120多萬份,圖書館藏書27萬冊。新建成的種質資源庫、綜合科研樓、圖書館和網絡信息中心、物業中心樓、文化廣場及新改造的植物標本館、植物化學樓(華立樓)和兩幢研究生公寓為研究所全面開展工作提供了良好的技術支撐和后勤服務。
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依托研究所:中國科學院昆明植物研究所